ويتألف من الشعب التالية :-
– شعبة حسابات الخطة الاستثمارية:-
تقوم الشعبة بتنفيذ النفقات للمشاريع الراسمالية ضمن الموازنة الاستثمارية للمشاريع المتعاقدة مع الجامعة وصرف التخصصيات المعتمده من خلال تدقيق واحتساب ذرعات العمل المقدمة من قبل القسم الهندسي ومتابعة التمويل المطلق من قبل وزارة التخطيط واعداد جداول مبوبة شهريأ تتضمن مصروفاتها الذي تتوقف عليه اليه التمويل من وزارة المالية واعداد الموازين الشهرية ومتابعة المناقلات بين المشاريع ضمن الخطة السنوية للموازنة الاستثمارية .
– شعبة صندوق التعليم العالي :-
سد الاختناقات ضمن الموازنة التشغيلية و توزيع الحوافز السنوية و استلام الايرادات بكافة انواعها.
– شعبة المخازن المركزية:-
تلبية احتياجات اقسام الجامعة من المواد المشتراة من قبل اللجان المركزية للموجودات الثابتة والاجهزة والمعدات والقرطاسية والاستهلاكية والرياضية والادوات الاحتياطية للسيارات واستلام الهدايا والهبات من قبل الوزارة وتوزيعها على الكليات والمراكز والمعاهد وحسب توجيهات رئيس الجامعة وجرد الموجودات الخاصة باقسام الجامعة وتشكيل لجان الشطب لغرض شطب المواد المستهلكه بعد استحصال الموافقات الاصولية ومتابعة المخازن وتنظيمها بكل ما يتعلق بأدخل المواد واخراجها ضمن سجلات شعبة التجهيزات .
– شعبة حسابات الموازنة الاعتيادية:-
تعتبر شعبة الحسابات ضمن تشكيلات التي يتم تمويلها اسوة بالكليات والمعاهد التابعة للجامعة وهي تقوم بتنفيذ الموازنة التي تتعلق بالمستلزمات الخدمية والسلعية وصيانة الموجودات بعد استحصال الموافقات الاصولية من خلال صرف الرواتب والمخصصات وتمشية كافة المعاملات الخاصه بمركز الجامعة .
– شعبة التوحيد و التقارير:-
جمع و توحيد موازين المراجعة الصادرة عن الكليات و المعاهد بميزان موحد.
– شعبة التخطيط المالي:-
تقوم الشعبة بتهيئة واعداد الموازنة التقديرية السنوية ومناقشتها مع وزارة المالية وتحديد احتياجات ومستلزمات الكليات والمعاهد والمراكز التابعة للجامعة من خلال توفيرالتخصيصات المالية للمستلزمات السلعية والخدمية والموجودات الثابتة والصيانة وتمويل الرواتب ومتابعتها شهريا مع وزارة المالية ومتابعة المناقلات بين اعتمادات تخصيصات الموازنة ومتابعة الكتب الواردة من الوزارة والتعليمات وتعميمها على التشكيلات التابعة للجامعة ومتابعة الكتب والاستفسارات الواردة من الكليات والمعاهد واقسام الجامعة والاجابة عليها.